外界爆发激烈争论的同时，课题组内部也陷入了巨大的困扰当中。为了避嫌，他们做出了一个决定，就是让实验继续下去。那位心理咨询师所采取的办法越来越极端，而林南一的身体状况也越来越糟糕。一边被他折腾的大口吐黑血四肢抽搐，一边又觉得他随时有可能醒过来。在一个星期内有七次被折腾进了急救室，可每一次都能奇迹般的挽过来。这位心理咨询师越玩越兴奋，终于有一次林南一似乎真的断气了。医生忙活了半天都没有缓过来，这个时候主任医师走过来，对那位心理咨询师，说：“你终于成功了……”
一听这话他立刻一边跳跃一边欢呼，等他跳累了主任医师接着说：“我是说你已经成功的把他折腾死了。”林南一被盖了一张白布，推出了急救室，这位心理咨询师把白布掀开，疯狂的往林南一脸上甩耳光。终于有人过来把他拦住了，课题组这个时候应该作何反应呢？大家坐在一起讨论。加凰说：“我们与林先生的家属之间有签约，所以绝不能把遗体交给别人。”所以凭借着这样一份约定，他们立刻把林南一的遗体运回了课题组。尽管如此，消息很快传遍了，这位心理咨询师并没有藏起来，而是直接面对悠悠之口，他对着镜头说：“我所使用的方法是非常科学的，也是非常安全的，之所以会出现这样的意外，是因为课题组没有提供给我们准确的数据，说的更直白一点，就是课题组对我隐瞒了林先生的真实身体状况。”于是大家把攻击的矛头对准了课题组。
在无奈之下，课题组也出来面对镜头，加凰说：“虽然医生已经宣布林先生死亡，但我们还在尽我们的努力，虽然林先生的呼吸已经停止了，但体温还在。我们会使用一款新型的机器人，这个机器人的个头就像是人血液的细胞一样大小。我们会把它注入林先生的体内，由他们把外面的清气带进去，再把里面的浊气排出去，用气流来推动血液循环。我相信我能够创造这样的奇迹，我也相信我们能够完成最终的目标。如果我们不让那位心理咨询师继续他的实验，社会就会认为我们毁灭了一种将林南一唤醒的可能。现在大家普遍都觉得我们之前做错了，说明这种可能就不该有，所以我希望无论如何不要再有人像我们建议继续这种做法。”
课题组的抢救行动持续了整整七天，到了第四天家黄昏了过去，其他人也累瘫在地。这些人睡了整整三天，终于发现金扳指重新开始记录数据。于是他们向社会宣布自己的抢救行动已经成功，并且公布了相关的证据。这个时候，这位心理咨询师再一次对课题组发起了攻击，表示林南一在医院发生意外的时候，课题组没有在第一时间投入到抢救行动当中。只等到医院宣布放弃抢救之后他们才接手，这说明他们有意用自己的方式终止之前的尝试。结论是要求课题组向他道歉，并且让他继续之前的做法。
加凰说：“我们之前没有不同意，你的这些做法是因为我们想要避嫌经历了，这么一回我们不想再避嫌了，无论怎么样，就是不同意你做。也不可能给你道歉，我们跟你没有共同的价值观，也不可能跟你再次合作，如果你想继续自己的实验，拜托你自己去找别的标本。”对方想要对课题组发起诉讼，为此他咨询了律师，但律师给出的建议是他的诉讼不会成功。于是他对课题组进行了道德施压，但课题组利用自己手上的协议，无论如何都不同意，继续之前的做法。
抢救行动成功之后，课题组为了治疗林南一的伤，发明了一系列的专利技术。与此同时，林南一自己沉浸在另一个时空，仿佛经历了一场无望之灾，来到了清园。这是著名高等学府，这里的建筑体现出一种古典的风格，有山有水，有树木，有草有花。甚至还能够看到麋鹿、丹顶鹤，水里养着金鱼。在宿舍和教室经常能够看到各种野猫，虽然是野猫，工作人员会对他们进行形象管理。第一天来报道的时候，面对的是一群穿着非常体面的工作人员。特别是一位戴着粉色边眼镜的女教师，让他感到印象深刻。这位女教师形象极好，洋溢着青春之光，如此美好，如此浪漫。这里的每一棵草，每一朵花，每一缕风，都让人难忘。来学校报到的时候，途中遇到一个人来打听学校的情况，后来与这个人住进了同一间宿舍。
一间宿舍一共住着七个人，初次相见时总是让人感到美好。后来发生的事情总会对初印象进行破坏，因为当第一次遇到的时候，每个人都会表现的比较拘谨。而随着岁月的流逝，人会逐渐显露出自己的本性。这个时候他的脑海中又浮现出阳明之学的内容，按照四句教的意思，第一句无善无恶心之体。既然心的本体是无善无恶的，那么一切都应该是无善无恶的。而这样的一种认知，显然不是活在真实的世界里，因为在真实的世界里一定有需求，一定有围绕着需求，所面对的竞争一定有面对竞争是所做的权衡。在这个时候选择了天理就是善，选择了人欲就是恶。
王夫之说，天理就在人欲当中。不能说这么说，一点道理都没有。比如说男女之事，如果发生在夫妻之间就是天理，若是发生在路人之间就是人欲。虽然不体面，但也谈不上恶，如果发生时不是出于双方自愿，如果带有强迫，而且手段极为恶劣，就好比水往低处流是天理，所以泛滥的洪水当中也有天理。面对这种洪水必须加以治理，而不是熟视无睹。所谓存天理，去人欲的过程，就是使水流不再泛滥。把多余的部分去掉，一切都能够做到恰当好处，这种恰当好处叫做中，人不应该时常游荡在中之外，而是住在中之内，下回分解。
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