行星表面一个不寻常的特征是众多的压缩皱褶或峭壁，在平原表面交错着。随着行星内部的冷却，它可能会略为收缩，并且表面开始变型，造成了这些特征。凹陷也在其它地形，像是坑穴和平滑的平原，顶部看见，显示这些皱褶是在如今才形成的。水星的表面也会被太阳扭曲——太阳对水星的潮汐力比月球对地球的强17倍。信使号在水星北极地区发现了水星上最大的火山平原开阔区之一，覆盖面积约400万平方千米，深度几千米。它帮助确认了火山活动在水星历史的大多数时间里对于塑造其地壳起到了关键作用。
水星的表面很像月球，满布着环形山、大平原、盆地、辐射纹和断崖。于是，水星上的环形山和月球上的环形山一样，也进行了命名。水星表面上环形山的名字都是以文学艺术家的名字来命名的，没有科学家，这是因为月面环形山大都用科学家的名字命名了。水星表面被命名的环形山直径都在20千米以上，而且都位于水星的西半球这些名人的大名将永远与日月争辉，纪念他们为人类作出的贡献。
水星是太阳系内与地球相似的4颗类地行星之一，有着与地球一样的岩石个体。它在赤道的半径为2439.7千米，是太阳系中最小的行星，水星甚至比一些巨大的天然卫星，比如木卫三和土卫六还要小，虽然质量更大一些。水星由大约70%的金属和30%的硅酸盐材料组成，水星的密度为5.427g\/cm3，在太阳系中是第二高的，仅次于地球的5.515g\/cm3。如果不考虑重力压缩对物质密度的影响，水星物质的密度将是最高的。未经重力压缩的水星物质密度是5.3 g\/cm3，相较之下地球物质只有4.4g\/cm3。
从水星的密度可以推测其内部结构细节。地球的高密度，特别是核心的高密度，是由重力压缩所导致的。水星的质量与重力较小，内部没有重力挤压效应，其核心含铁量较大而具有较高的密度。地质学家估计水星的核心占有体积的42%；地球的核心只占体积的17%。水星富铁的核心占据了其总质量的至少60%，它的半径更是达到了水星半径的四分之三。最近的研究强烈支持水星有一个熔融的核心，包围着核心的是500–700千米厚的硅酸盐地幔。太阳系类地行星中，只有水星和地球拥有全球性的磁场。天文学家认为这些磁场是由它们核心外层中的电流所产生。根据水手10号任务和从地球观察的资料，水星的地壳被认为只有100-300千米的厚度。水星表面的一大特征是有无数的窄脊，可以延伸到数百千米长，相信都是在水星的地壳凝固后，核心和地幔因冷却而收缩造成的。
水星核心含有的铁高出太阳系内其他主要行星，已经有几种理论被提出来解释。得到最广泛支持的理论是水星原本有着类于于常见的球粒陨石金属-硅酸盐比率的核心，被认为是太阳系内典型的岩石物质，质量大约是当前质量的2.25倍。