猎魂之战三个月之后，唐三带着史莱克七怪的其他成员来到了海神岛。如原着中一样，小舞还是没能逃脱献祭的命运。这不是刘司凡不去救人，而是刘司凡认为救不救都一样，最终结果男女主角都会没事，费那个劲去救干啥。刘司凡以前也看一些小说，发现诸天流各种拯救主角，也是无语了。男女主角只要不是虐主类的基本不用你去救，即使虐主，主角也死不了，死了就结局了。他们自己最终都会有好结局，要救的倒是那种很惨的配角。还有系统流的发布的任务也是各种帮主角的，主角真不用你帮，他们自己的命运就已经够好了，帮了多此一举。
唐三把变成兔子的小舞给刘司凡看了看，刘司凡观察了一段时间顺便收集了点数据。小舞救倒是能救，但是唐三自己后期就能复活小舞，也就不想费这个心了。刘司凡告诉唐三复活小舞按他的原计划执行即可。唐三也是抱着侥幸心里试试，毕竟刘司凡创造了太多的奇迹。听到刘司凡的建议之后，唐三再次坚定了复活小舞的信念。接下来的几年除了宁荣荣和朱竹清之外史莱克七怪的其他成员开始了海神岛的试炼。
只过了两年，宁荣荣和朱竹清两人就双双突破到了99级，自动继承了九彩神女和速度之神的神位，直接成神。刘司凡终究是由于胃不好，吃上了软饭。连续两年他都在研究宁荣荣和朱竹清这两个“神”。如果不是亲密关系，刘司凡哪有这么好的机会可以直接研究这个世界的神。
刘司凡又花了两年时间，改造宁荣荣和朱竹清，使得她们具有了超神世界二代超级战士的部分能力。她们的身体是这个世界的神，在硬件上已经可以达到超神世界二代超级战士的水平。软件却是采用第一代超级基因技术的软件部分，所以还无法完全释放她们的潜力。
按照超神世界的设定，二代超级基因技术产生的二代超级战士可以达到的计算能力巅峰是4频（参考饕餮的噬獆）。频这个单位在超神学院的世界指的是计算力，其实也指的是能量操控能力。根据支持乾坤（30频）的紫韵星计算，释放的能量相当于每秒30万吨氢聚变释放的威力，相当于太阳的2000分之一。太阳功率3.8x10^26瓦，所以紫韵星功率为1.9x10^23瓦。结论是产生1频算力必须能够操控6.3x10^21瓦的能量。
暗物质计算机的能效比强于光量子计算机，光量子计算机又强于现世的超级计算机（作者设定）。按照现世超算最高能效比1.7x10^10次浮点运算每瓦，推算光量子计算机算力能效比为1.0x10^34次浮点运算每瓦，暗物质计算机算力能效比假设为1.0x10^48次浮点运算每瓦。笔者估算出了一个大概，即1频的算力为6.3x10^69次浮点运算每秒。
改造之后宁荣荣和朱竹清的算力勉强达到了1频，没办法软件技术只是第一代。刘司凡将两台计算姬并联使用，终于有了在5年内解析第二代超级基因技术的能力。
刘司凡在前几个世界勉强就解析了千分之几的第二代超级基因技术，除了超神世界，其他世界计算能力是真的差了好多。刘司凡总算在斗罗大陆重新用上了按频为算力单位的研发“设备”-计算姬。用过德诺三号的刘司凡被前几个世界的算力折磨的够呛的，就像是用惯了4G5G突然给你换成2G网谁受的了。德诺三号应该是个比乾坤差些的小型天体计算机。刘司凡改造完宁荣荣和朱竹清之后，开始全力解析第二代超级基因技术。
四年时间唐三等人也初步完成了海神考核，唐三第一次离岛开始全面阻击武魂帝国的扩张。宁荣荣和朱竹清要在海神岛配合刘司凡解析第二代超级基因技术，所以没有亲自参与阻击武魂帝国，而九宝琉璃宗也要恪守隐世中立的原则。
少了九宝琉璃宗、宁荣荣和朱竹清的参与，唐三的唐门日子会难过许多，但主角就是主角，即使如原着中死掉也会有人复活。原着复活唐三的是宁荣荣和奥斯卡，这次虽然没了宁荣荣和奥斯卡的组合，但是刘司凡可不认为海神会在一边看着，作弊复活一下唐三自然是小菜一碟。
仅仅一年，唐三成神，原本拥有大好局势的武魂帝国就兵败，比比东身死。刘司凡也只是略微关注一下，这事有神界看着，结果不会和原着有什么大的出入的。一切都是按着神界的剧本在实行。只是可惜了比比东，这家伙虽然是个政客利用了底层的力量，但是起码给了底层一点希望。不过只要这个世界有神界，就没法改变什么。不论是现实、仙侠以及科幻大概都逃不了强与弱的对比。那句“毁灭你和你无关”的话，如果你比他们强，这句话是不成立的。
按照原着的剧情千刃雪没死，刘司凡出面将她收留。这家伙虽然神位破碎但身体硬件仍然是第二代超级战士的水平，装上了第一代超级基因的软件，妥妥的又一台计算姬。至于收留她的其他原因懂的都懂，不懂的说了也不懂。
剧情结束的第一年，没了武魂帝国的压制和杀戮之都的收留，邪魂师开始在斗罗大陆泛滥开来。也是这年盖世龙蛇夫妇带着孙女孟依然投奔刘司凡，这两个老家伙看大陆混乱，加上为了成全孟依然，就带着她找刘司凡。刘司凡看着头大，不过最终还是收留了孟依然。对孟依然的改造路线是先常规改造到达99级，然后利用这几年研究这个世界的“神”和信仰之力的成果，让她信仰成神，最后就可以收获一台计算姬。
刘司凡将“森林之神”、“异兽之神”之类的比较契合孟依然的概念念力从神界引导下来，过程中尽量避免了和其他神位的冲突。当然这也是有唐三、宁荣荣和朱竹清这些神的支持才没出事。唐三的关系该用还是要用的嘛，刘司凡可不会客气。
孟依然在剧情结束的第三年成为了历史以来的第二个信仰之力成神的人，这也宣告着刘司凡的实验成功了。收获第四台计算姬的刘司凡，第二代超级基因技术的解析工作也进入了尾声，多了两个计算姬完工时间自然提前了。
历经多个世界，刘司凡终于将第二代超级基因技术解析完成。摆脱繁重解析计算任务的五人开始全力运作先启司收集材料。为了材料刘司凡甚至领衔研发制造了斗罗大陆第一套卫星导航定位及资源探测系统“天眼系统”。没有办法，第二代超级基因技术的资源需求实在是有点多。毕竟超神世界满宇宙收刮也就天使和烈阳勉强完成了第二代超级战士的量产。还好斗罗星算是资源丰富，即使是单颗星球也勉强够5人进行系统升级。
完成升级的刘司凡数据如下：
硬件：国产二代超级基因；
能源：生物能、暗能量、外接能源端口；
操作系统：圣心、武魂-黑洞；
驱动引擎：暗能量驱动、炁驱动、生物能驱动；