另一派是忠诚正直，自负气节敢于直谏着称的那帮官员们。他们看到朝政日益腐败、政治危机日益加深，忧心忡忡，强烈要求改良，思想比较进步。虽也有投机分子混迹其中，但大多数还是正直的，故称为正直派。
邪派在这场尖锐的斗争中占据主导地位，而正直派占次要地位。正直派同邪派进行了长期较量，历史上称为“东林党议”。
自万历2 2年沈一贯入阁以后，纠集同籍者结为“浙党”。后又联合“齐党”、“楚党”(均以地域划分)，专门与“东林党”为敌。
说起来，“东林党”的起源是自然形成的。当年，顾宪成被罢官后在故乡“东林书院”讲学，同志者纷纷响应，经常聚集在一起，研习学问，议论国家大事，渐成气候，后来势力越来越大。其领袖人物有顾宪成、赵南星、邹元标、叶向高等人，故称“东林党”。
其后的几十年中，“东林党”与邪派官吏针锋相对，互相攻击，斗争十分激烈——这是后话。
显然。双方都把这次“京察”当作排挤、攻击对方的良机。明代考核官吏分为“京察”和“外察”两种。“京察”就是考察京官，规定逢巳、亥之年进行，每6年考祭一次。
四品以上官吏采取首先个人述职，然后由京察机构给予裁定；考察合格及优秀者，可提拔升迁；不合格者，则给提前致仕、降调、罢官等项处分。凡是在“京察”中被罢官的，终身不复起用。
因而，在每次“京察”中，各党派恨不得把对方踢向被查办、罢官的境地。京察时主持察典的是吏部尚书、都察院左都御史、吏科都给事中、河南道御史和吏部文选郎中。因此，每当京察之时，这几个职位就成为各党派争夺的焦点。
吏部的行政事务纷繁杂乱，有很多是前面积压下来的。
赵南星上任以后，废寝忘食、通宵达旦，忙得不亦乐乎。没多长时间，就把积压在考功司的事处理得井井有条，妥妥贴贴。
孙珑对南星的表现非常满意。倏忽问，几个月过去，转眼便是冬去春来、春暖花开的季节。按照原定的计划，京察也将开始了。
这天，赵南星来到孙珑的公厅商议京察事宜。二人坐定之后，孙珑问道：“这次京察，许多人对咱们寄予厚望，希望咱们能秉公执法，将受百姓欢迎的官员选拔出来，将那些贪赃枉法、欺压百姓的贪官淘汰掉。一句话，要公平公正，大公无私。要做到这一点，你认为最重要的是要从哪几方面入手呢?”
南星深思熟虑地说：“对这个问题，我已经考虑很久了。第一，必须废除‘请教’(考察前，主持察典的官员须向内阁打招呼，内阁赏识的人即使贪污受贿、品行不端者也必须留用；内阁厌恶的人，虽有才干、业绩突出也必须罢黜。向内阁打招呼的过程称为“请教”)这道程序。实际上，过了‘请教’这一关，那些被内阁保护的奸佞官员就等于获得了‘护官符’，任何人对他们奈何不得。这很不公平。多少次京察，皆因内阁掣肘，奸佞、谗臣得不到追究、查办，而忠诚正直的官员却莫名其妙地遭遇大祸。