空中飞艇终于发现清军的火箭炮，并将其立即摧毁。
此时，清军中最大的威胁已经被解除。
接下来，便可以放开手脚对南京城发动攻击了。
根据战前的情报来看，洪承畴率军南下后，南京城内的清军只有两万人。
结合空中编队在南京城上空巡视的情报来看，南京城内最多也就两万五千人。
对于朱君洛来说，只有两万五千人驻守的南京城，根本不足为惧。
在太平洋舰队和空中编队的强大火力支援下，南京城只靠这点比例，根本无法守住。于是朱军落在收到空中编队的警报后，立即下令太平洋舰队向南京城发起猛攻。
同时命令空中编队向南京城内的清军聚集点和重要的城防工事，发起空中火力打击。
很快，太平洋舰队各主力战舰开始了猛烈的火炮射击。
同时空中编队分成四个分队，分别在南京城内寻找清军聚集点和重要目标进行火力打击。
而南京城内的清军在推动火箭炮的依仗之后，坚守南京城的信心彻底瓦解。
南京城内的驻军将领和文武官员第一时间想到的并不是如何组织其有效的防御力量，与明军决一死战。
而是先想着如何保全自己的性命。
很快，一众将领和文武官员便立即带着家眷，从南京城的东门逃离。
而在城内的清军士兵们看到领头的将领和当官的已经跑了大半。
本就士气极为低落的他们，也开始四散而逃。
而在长江水道上的太平洋舰队经过几轮火炮密集的齐射之后，开始向长江南岸运送登陆的部队。
秦锐率领着第一军率先登陆。
第二军和第三军分别在南京城的东西两侧登陆。
三个野战军同时向南京城的三个方向发起进攻。
此时的南京城城墙上以经没有几个清军在驻守了，大部分都已经四散逃跑。
在明军陆海空三军的猛烈攻击下南京城被迅速攻破。
南京城被占领后，秦锐奉命率领第一军向南京城东南方向前进。
并派出大批骑兵追击逃跑的南京城家里和官员。
但由于管效忠跑的太快，而且他是最早出城的那一批官员。
此时跑的已经很远了，秦瑞只好下令骑兵部队先行撤回。
在追击的过程中，只抓到了大批的清军将领家眷和一些金银、珠宝、字画等细软。
在攻下南京城后，朱君洛立即派第三军前去攻占镇江以及周边的地区。
第二军负责镇守南京城。
第一军则在南京城外布置防线。
朱君洛考虑到现在浙江境内大片区域还没有被收复。
在后方不稳定的情况下，贸然渡江攻占长江以北区域并不可取。
那样容易在长江以北遭到清军的围剿，很容易陷入孤军奋战的境地。
所以朱君洛让第一军负责南京城以西长江南岸的防线。
第三军负责南京城以东长江南岸的防线。