《深宅大院》讲述的是在一个大宅院中发生的故事，老爷除了大太太之外，还有四房姨太太。
老爷和大太太是少年夫妻，两家都是当地的富庶大族，算是联姻，家里唯一的男嗣就是大太太生的大少爷。
大太太常年吃斋念佛；二姨太是戏子出身，整日里浓妆艳抹，育有一女；三姨太因为丧子之痛，这些年来一直疯疯癫癫的；
四姨太是被他父亲抵债卖进府里的，做事八面玲珑，经常跟老爷出门应酬；五姨太是老爷前两年刚纳进门的，最是年轻貌美，深得老爷喜爱。
故事的一开始是佣人发现在死在了雪地里的二姨太的女儿，打破了整个后宅表面上的平衡。
二姨太知道三姨太是装疯，联合她一起查自己女儿的死因，从而揭露出了大太太的佛口蛇心的真面目，当年三姨太刚出生的儿子也是被大太太害死的。
四姨太喜欢的人是大少爷，她这些年来跟着老爷跑东走西的做生意，是为了帮大少爷挣家产，而大少爷喜欢人是五姨太。
五姨太未入府之前是个街头卖花的贫女，与母亲相依为命，她原本和大少爷相识相爱，但是母亲无意中冲撞了老爷的马车，被马夫活生生打死了。
心爱之人变成了仇人之子，她无法接受，狠心拒绝了大少爷，并且转头嫁给老爷当了五姨太，想要报仇。
二姨太和三姨太想要找人结盟对付大太太，将主意打到了深受老爷喜爱的五姨太身上，她们在探知五姨太进府的目的之后，帮着她查出了真相。
原来是大太太不想看到大少爷和贫女在一起，故意设计了五姨太母亲的死。甚至在五姨太入府之后，大太太利用四姨太对大少爷的心思，让她对五姨太生出怨怼之意，从而出手陷害五姨太。
但是四姨太的陷害之举被老爷识破，落了个被打的半死，扔出府，死在外头的结局。
三位姨太太在老爷面前揭穿了大太太的罪行，但是被大太太反将一军。
原来二姨太的女儿并非老爷的孩子，而是她和管家偷情生的。
至于三姨太这些年表面上装疯卖傻，实则借着府里的名义，帮着她的娘家在外头放印子钱。
而五姨太进府报仇的事情也被揭露，老爷直接宣布，将三位姨太太和管家一同沉塘。
故事的结局，四个被沉塘的人中，只有五姨太被大少爷救了出来，并且送她远走他乡，其他人都死了。
偌大的府宅又空旷了下来，老爷的身边依旧只有大太太。
两人的最后一段对话耐人寻味，看似一切大太太是最狠的人，实则老爷知道一切，二姨太偷情、三姨太放印子钱、五姨太进府报仇，他是借着大夫人的手除掉了这些人。
至于先前就死了的四姨太，是心太大了，生出了不该有的念头。
暗中操控着一切的人，是老爷。
三姨太的儿子是老爷默许大太太害死的，因为他的家业只会留给大少爷，其他的姨太太生出了儿子注定是个死局，老爷从来不曾将那些姨太太当做过人，只不过是个消遣的玩意儿。
唯有大太太，和他一样出身富贵，才有不被他舍弃的资本。
最后，大太太又去帮老爷物色新的姨太太。
而大少爷只是默默地看着这一切，他留在这个深宅之中，就代表着他要继承父亲的一切，无论是金钱，还是思想。