元始天尊惩罚了违背天道的多宝道人，随之绝仙阵也就覆灭了，多宝道人邪恶之体均已被元始天尊所诛杀，灵魂得到烈火的焚烧已洁净升华，最终魂归封神榜，等待姜尚伐商兴周之大业完成后，封神台上封禅诸位新天神，以正乾坤。元始天尊这时动用意念察觉而出，阐截两教之劫数固然如期而至，起因乃是阐教叛徒申公豹，元始天尊对弟子姜尚言道：“姜尚听命，本尊命你到三十六重天之兜率宫。将你师叔道德天尊请到此处，两教有此一劫只有道德师弟能化解此劫。”
这时阐教叛徒申公豹从绝仙阵逃出之后，立刻前往碧游宫通天教主之住处，申公豹不顾颜面直往里闯，申公豹边闯边叫苦言道：“通天师叔，您要为多宝师兄报仇雪恨。”通天教主对申公豹言道：“申公豹，多宝有此一劫。本尊奉劝于尔，就此收手且莫再违背天道。而赴了多宝之后尘，以周代商乃天意所为。”申公豹听得此言，便开始了一番颠倒乾坤之言语，申公豹对通天师叔言道：“师叔啊，您可知修道之人是怎么评价截教中人欤？”通天教主一语不发就想听听申公豹如何编排与挑拨两教关系的，通天教主对申公豹言道：“师侄不急，坐下慢慢对本尊言之。”申公豹见得师叔如此待他，于是就放心来坐下开始颠倒乾坤了。
申公豹对通天师叔就畅所欲言道：“通天师叔，那些修道之人说截教就是......。”通天教主言道：“师侄，本尊今恕你无罪。”申公豹继续言道：“截教就是畜生之道，就算修到高处却还是畜生。”通天教主听得此言，发出雷霆之怒。通天教主震怒的对申公豹言道：“大胆申公豹，竟然在本尊面前侮辱本教。看来师兄元始天尊做的对，像尔等这般叛徒且死有余辜。申公豹休得逃走，本尊要为阐截两教清理门户。”申公豹听得此言之后，于是立刻向通天教主继续颠倒是非。
申公豹再次对通天教主言道：“通天师叔，弟子怎敢对师叔您不敬。此类侮辱截教之言，实乃出自我师父元始天尊之口。弟子若有半点虚言，请师叔严惩。”通天教主见得申公豹神情严谨毫无虚言之状，就收起诛仙剑再次让申公豹坐下言谈，通天教主对申公豹言道：“申公豹，尔今被师兄元始逐出师门。拜本尊为师，可愿于否。”申公豹听得此言甚为欣喜，立刻跪地就拜，申公豹向师尊通天教主言道：“通天师尊在上，受弟子申公豹一拜！”通天对申公豹言道：“申公豹，事不宜迟。即刻随为师修炼诛仙阵，待此阵法修炼完毕之时，乃阐教众仙阵亡之日。”
通天教主领着申公豹就进入关内进行修炼，分别有三位师兄在修炼其他三阵：暗渊道人坐镇诛仙阵、金光道人坐镇戮仙阵、龟灵道人坐镇陷仙阵、申公豹坐镇绝仙阵，四阵法宝分别是：离火诛仙剑、泽兑戮仙剑、水坎陷仙剑、雷震绝仙剑。之前多宝道人布下的绝仙阵乃是小试牛刀，这次乃是通天教主亲自坐镇的诛灭万仙阵，通天教主受了申公豹的蛊惑，摆出了天下至恶之阵法，想与两位师兄在此阵法上一决高下，并且还收下了阐教叛徒申公豹，以此挑战元始之底线。
自上次多宝道人被元始天尊所诛杀之后，元始天尊启用慧灵观察三界发现阐截两教劫数难逃，就命杨戬去找道德天尊前来化解此劫数，杨戬到了三十六重天的兜率宫时，正逢道德天尊在与灵宝、准古两大天尊在商讨此事，杨戬在兜率宫外等了好一阵，道德天尊、灵宝天尊与准提天尊，三圣随杨戬步入凡尘拯救黎民。杨戬将三圣请到西岐与师祖元始天尊汇合，女娲圣尊则在西岐帮杨婵提升宝莲灯的最高法术，因为此战之决胜全靠宝莲灯与无字天书之力量来把握全场了，女娲圣尊也将卷入此次封神之决战，元始天尊命令传下，令十二金仙下山助战，届时广成子、赤精子、黄龙真人、惧留孙、太乙真人等十二位金仙下山铲除诛仙。
结合这十二金仙之力，此次诛仙之战均有二十四名金圣之仙，十二金仙与其弟子，而且还有四方修道之正人君子，元始天尊率领着杨戬、杨婵、武吉、崇黑虎、姜文焕、南宫婉儿这六位将领和四百五十名梅山道人攻向诛仙阵。道德天尊率领姜尚、李靖、金吒、木吒、哪吒、杨蛟六员神将共同攻入戮仙阵，灵宝天尊联合准古天尊率领广成子、赤精子、黄龙真人、惧留孙、太乙真人、灵宝道君、广法天尊、普贤真人、慈航道人、玉鼎真人、道行天尊、清虚道德真君一举攻向陷仙阵和绝仙阵，四大天尊率领二十四仙圣共同对付通天所设之诛灭万仙阵。
元始天尊率领杨戬、杨婵等六员神将攻入暗渊道人把守的诛仙阵，到了诛仙阵用眼望去只见门前悬挂着一鐏非铜非铁亦非钢之神剑，元始天尊见得此神剑直言道：“杨戬，尔等要慎之又慎。”杨戬反问元始师祖言道：“师祖，为何却这般惧怕？”元始天尊回杨戬言道：“杨戬有所不知，尔可听言之。非铜非铁亦非钢，须弥山下万年藏。乾坤颠倒阴阳炼，无泽烽火铸锋芒？利诛仙，仙戮亡，四方陷仙起赤光。无穷变化绝仙妙，远古金仙血染裳。”杨戬等六员神将听得元始师祖如此描述诛灭万仙阵，觉得此番封神决战真乃史无前例之战，自告奋勇之。
首先由四大天尊到诛灭万仙阵一探虚实，元始天尊来到了暗渊道人持守的诛仙阵，暗渊道人向元始师伯言道：“元始师伯，今如能破得此阵，吾将退之。若无法破得此阵，那就勿怪师侄冒犯于您，定削去师伯与尔等之顶上三花。”杨戬向暗渊道人狂怒言道：“暗渊老贼，切莫狂言欲出。可还记得吾之杨戬，尔等曾是吾手下败将。如今得了通天师叔祖之真传，不曾劝阻通天师叔祖，反而纵涌师叔祖与天道相背驰。暗渊老贼，休走，吃某一戟。”杨戬言罢，就陷入了战斗。
此暗渊并非彼暗渊，暗渊道人还在阵前道台之上坐着呢，与杨戬开战之暗渊乃是暗渊之灵，元始天尊命杨婵言道：“杨婵，快拿出宝莲灯，使用圣灯之光，清除杨戬邪恶之念。若不及时清除，则后患无穷。”杨婵立刻拿出宝莲灯，使用七彩圣光消除了杨戬的邪恶之念，等杨戬清醒之后才发现，差点将自己战死。暗渊道人运用的是邪恶之渊道法，开启神人之间的邪恶之渊，使开启之人自我消亡。元始天尊对杨戬言道：“杨戬，可还记得玉鼎，对你之教诲否？”杨戬此时双目紧闭盘膝而坐，启用内心深处之灵宙在领悟道语，此时只见杨戬之天眼发出了道道金光，杨戬领悟了玉鼎真人之道，功力增长了数万倍，能匹敌此阵之力量。