在小智获得彩虹徽章之后，三人离开彩虹市，他们朝着浅红道馆前进。
三人通过地图的指示继续向前进发，他们现在所在一个叫迷幻市的城市，这里的建筑和彩虹市有的一拼，到处都是高楼大厦，让三人都感到茫然无措。
三人刚准备商讨接下来先在哪落脚，突然一个时髦、丰盈的大妈一把将小智抱进怀中，嘴中不断呼唤她儿子小一的名字。
她看到失踪多久的儿子突然出现在她面前，显得异常激动，有种失而复得的艰辛。
小智被这突如其来的阿姨给搞迷糊了，她被阿姨热情的拥抱快要窒息了，阿姨胸前那两对宝贝差点让他无法呼吸。
身旁的小霞、小刚两人感到困惑不已，这个阿姨是不是认错人了？
小智在阿姨怀中不断挣扎，显得快要窒息了，阿姨感到了怀中的异动，连忙松开了手
死里逃生的小智喘着呼吸，对着阿姨说：“阿姨你认错人了，我叫小智不叫小一”身后的小霞两人关心小智，问他是否要紧
小智摇了摇头，对面听到小智说话的阿姨听闻后面露悲伤
她向小智道歉：“不好意思，小智，你长的太像我的儿子小一了
阿姨一时太过于激动了，给你添麻烦了，我很抱歉，小智”说完她又抽泣起来，她可怜的儿子小一到底在哪里啊？
小智三人面面相觑，这阿姨也太可怜了吧，儿子丢了，这座城市看来不太安全啊！！！
小智三人连忙安慰阿姨，小智想到作为母亲的不容易，他想到妈妈花子也对他是操心不已
他对阿姨道：“阿姨。我没事，你不要伤心，你请放心，我们帮你一起寻找小一的下落”
原本还在抽泣的阿姨听到小智这么说，停止了哭泣：“真的吗？”她显得不太相信
小智三人点点头，看到三人点头答应，阿姨连忙感激小智他们。
正当他们打算寻找小一时，开着警车的君莎小姐驶过他们面前
她从车上下来，手上又拿出一张失踪人口的画像和讯息，她将这张画像再次贴在墙上。
只见墙上已经贴满了失踪人员的画像，上面都是这段时间失踪的年轻的少男少女，
阿姨告诉小智等人，她的小一也在其中和其他的孩子一样突然失踪。
小智让阿姨回家等消息，他们会帮她找到小一的，阿姨放心的点点头便离开了
三人走向正在贴海报的君莎小姐面前，热情的协助君莎小姐张贴海报，忙完工作的君莎小姐感谢小智三人的帮助
小智向君莎小姐询问失踪人口的进展，一边的君莎小姐叹了口气
一说这个她便产生一股无力，这么久了失踪人数越来越多，偏偏没有任何线索，她现在也是一头雾水，焦躁不安，压力山大啊！！！
小智三人听到这起案件的棘手，不由皱了皱眉，不过既然答应阿姨帮她寻找儿子，三人便不会食言。
小智三人恳请君莎小姐能够让他们协助调查，君莎小姐看到三人真挚的眼神
想道：“算了，多一份力量，多一分希望，说不定真能找到什么线索”她点了点头
见到君莎小姐答应，小智三人松了口气
君莎小姐告诫他们协助她可以，但是可不能给她添乱，三人赶忙点点头。
君莎小姐带他们去失踪前的地点去寻找线索，四人来到当地的宝可梦中心询问在场的人员
经过多番打听，从当地的人群中了解到失踪的人们出现在过精灵中心
在经过向宝可梦中心的护士小姐的问询，发现宝可梦中心也发生了一起怪事。宝可梦中心很多的宝可梦们都无精打采，失去了活力。
小智三人和君沙小姐对此将这类事件和人口走失事件相关联，还未仔细搜寻，君沙小姐腰带上携带的感应器发出响动，收到未知的信号。
君沙小姐对此并不吃惊，她已经见怪不怪了。她告诉好奇的小智三人，最近总是有些莫名的电波传到本市，这信号十分隐蔽，来也匆匆，去也匆匆，让人摸不着头脑