【在帅旗被射成刺猬的第二天，两军又开战，而在战斗中又出现了猛烈的大风，朝廷的军队又败了。在这期间总共遇见了三次，这也让朱棣更加坚信自己就是天命所归。
后面燕军作战都是屡战屡胜，但是由于燕王兵力不足，所以主要还是占领北平、保定、永平这几个地方。
直到建文三年(即1401年)冬，朱棣才决定直接率兵南下，直到建文四年(即1402年)六月十三，燕军抵达金陵。谷王朱橞与李景隆开金川门降，朱允炆在宫中放火，不知所终。而朱允炆的下落也成为千古之谜。
朱棣也在众人的拥护下登基，次年改年号为永乐元年。但是，需要注意的是，他是从他爹朱元璋手上接的皇位，而不是朱允炆】
朱元璋“什么鬼，咱不都死了四年了吗”
【不管现实是怎样，反正朱棣就说他是在洪武三十五年他爹朱元璋传位给他，压根就不承认朱允炆的皇位。而且他还改史，说他爹朱元璋素来不喜欢朱标，对他有多么得喜欢，试图隐瞒他得位不正的问题】
明朝朱元璋时期
朱元璋：“老四，你可真行”
朱樉：“老四，你说这话亏不亏心”
朱棣：“.......”
【同时他对于在建文年间被贬谪的官员都恢复官职，建文年间制定的与朱元璋当初制定的法规相悖的，也被废除。力图证明他得位之正，也许是因为这样，为了证明自己，所以朱棣在国事上确实是非常努力，才能创造永乐盛世】
朱元璋：“你认真管理国事没错，但不至于这样”
朱标也看着他的弟弟，相当无奈。
【说到明朝，大家印象最深的就是那句“天子守国门，君王死社稷”】
朱元璋默默念了好几次这句话，哈哈大笑，“不错！不错！天子守国门，君王死社稷，有我大明的气节。”
【而这句话的开始就得从永乐大帝朱棣得迁都开始】
朱标：“终于开始到四弟你的治世能力了，看看这永乐盛世是何种情况，哈哈哈！”
朱棣：“大哥.......”
朱元璋：“标儿说得没错，都好好看看。”
【由于之前朱棣当燕王时的领地在北平，也就是我们常说的北京，他在北平能够做到的事更多。并且由于他登基后对于朱允炆一脉的清算，南方士族的清算，所以南方对于他的认同感也没有北方强。而且当时已经没有有能力的藩王了，如果定都在南方，朱棣肯定还得再封藩王，不利于大明的统治。而且北方那边也不能不要，燕云十六洲是抵御外族非常重要的屏障，如果丢失，很有可能会落得和宋朝得下场，于是朱棣想要迁都北平。
可以说朱棣迁都北京的根本原因是北京特殊的地理条件，迁都北京有助于大明王朝加强对边境地区的控制。
另外迁都北京对朱棣的统治也有着重大意义，“靖难之役”时朱棣曾经对南京的大臣进行过残酷的屠杀，这虽然震慑了建文帝一朝的大臣，但也使他失去了南京士族的拥戴。
北平是朱棣过去的封地，在那里有很多朱棣之前的旧部。这对于加强统治来说十分有利。