在湛蓝道馆漂亮地打赢比赛，赢得打击徽章的小智，终于展开他在旋涡列岛的旅行了。
“呼！终于5个徽章了，总算赶上小茂了。”
“可是，小智，小茂在1月前就已经5个了，现在搞不好都收集齐了。”
“啊这？”
小智刚刚还沾沾自喜着，但小霞的话就像一盘冷水直接浇灭了他的热情。
“先别emo了，小智，你看前面！”
“这是旋涡列岛的特色，没什么好大惊小怪的。”
小智顺着小刚的指示，看见许多海上旋涡。
“说得没错，客人。”这时，好久不见的火箭队冒充服务员出现，赞同了小智的话语。
“喂！你们几个，不会以为换了身马甲我就会不认识你们了吧。”
“既然如此！我们就不装了！”
……
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……
火箭队被小智识破身份，直接来了个一秒换装。
“有皮卡丘的地方就有火箭队！”
“看我们将它捉起来！”
“喂！火箭队！”
“你们是怎么上这艘船的？”
“你还好意思说！”
“你挑战的那个什么湛蓝道馆！里面的日子过得实在太舒服了！”
“害得我们完全忘记了抓皮卡丘的事！”
“后来我们好不容易痛下决心，重操旧业，你却擅自登上了这艘船！”
“害得我们好不容易才潜藏进来的！”
火箭队七嘴八舌的痛斥着小智对他们的不公。
“那这么说，你们是偷渡的咯。”小霞立刻抓住了火箭队废话的重点。
“啊？这个…”火箭队有些语塞。
“不想被赶下船，那就给我老老实实的，不然，我疯起来自己都害怕！”
“啊！好可怕的小鬼头诶！”
看着小智核善的面容，火箭队抱在一起瑟瑟发抖。
虽然，小智也想直接打飞他们，但接下来的事情可能也需要他们的力量，再不济，也不能让他们四处捣乱，所以，这几个家伙还是带在身边最为保险。
“嗯？这个是！”
就在小智还想说些什么的时候，他突然感应到海中的某道身影。
来了吗，我等你很久了。
波导之力与我同在！
于是，小智利用波导之力想和对方沟通，可惜，对方并不信任小智，直接向着远处游走了。
哎！跑掉了，还是下次遇上再好好聊聊吧。
等到上岸后，小智还遇到了前来这里调查的空木博士。
于是，小智水深火热的日子再次开始了，被空木博士借走不停的迷失在研究之中。
……
经过连续多日的研究之后，小智终于被空木博士放了出来。
其实，主要是旋涡列岛大赛要开始了，不然，小智可没那么容易被空木博士提前保释。
而这回参加比赛的不止是小智，小霞作为水系神奇宝贝爱好者，也参加了这次的比赛。
他们先在神奇宝贝中心报名参加了预赛，结果显而易见，小智和小霞很轻松就通过了预赛。
最后他们也是赶往了最终比赛的地点，打算和那里的水系神奇宝贝高手来一决胜负…
……
“现在开始！要进行旋涡列岛大赛的开幕典礼！”
“各位观众请看，这些人就是通过预赛，以成为大海的勇者为目标的人！”
“自古以来，旋涡列岛就拥有独自的文明与文化，崇拜水系神奇宝贝与它们共同生存直到现在。”
“这文化并未消失，而由遵守着自古以来的传统的大海的神官，玛雅小姐继续传承着。”
旋涡列岛大赛的开幕式上，司仪激情四射的宣读着比赛开幕前的开场白，最后，当他介绍到神官玛雅时，在场所有人的目光全都聚焦到战场中央一位手持海王神杖的少女身上。
“多么高雅的女性呐！”
观战席的小刚，已经为少女的气质所倾倒。
“现在我们请玛雅小姐做大会宣言！”
“各位！欢迎你们光临三年一度的水系神奇宝贝的庆典，旋涡列岛大赛！”
“于水系神奇宝贝们心灵相通，一同生活的人们，在这个地方漩涡列岛上，自古以来都被歌颂为大海的勇者。”
“相传大海的勇者，是会受到海魂的祝福的，被授予和所有水系神奇宝贝相同的能力！”
“那么，祝各位健康如意，接受海魂的祝福吧！”
说着，玛雅高举神杖，上面的海魂宝石发出了耀眼的光芒。
“愿海神的祝福能有实现！”
“奥！！！”
最后，玛雅一句话点燃了全场激情！
“另外获得冠军的训练家，可以得到勇者的同时，还可以得到神秘的水滴。”
终于来了，我等的就是这个！
见到神秘的水滴，小智眼中泛起了精光。
随后，开幕仪式结束，所有选手都下去准备自己待会战斗的阵容了。
“小智，这次的比赛你打算用哪些家伙呢？”
电话视频中的大木博士对着小智问道。
“第一场是1对1的比赛，博士您先把小巨鳄传送过来吧。”
“小巨鳄吗，这小子还不太成熟哎，小智你确定吗？”
“没错！本来这次的大会我就打算以小巨鳄为主，好好历练一番的，最近的战斗它都没有参加多少，实力都有些跟不上其他伙伴了。”
“那好吧，我这边马上去准备。”
说完，大木博士去帮小智寻找小巨鳄去了。
……
大赛经过连绵不绝的战斗，终于到了小智的比赛，而小智的对手是一名带着眼镜的钓鱼少年，名字叫都里。
“出来吧！小巨鳄！”
“瓦尼瓦尼！”
小巨鳄还是老样子，一出场就来了一段哥哥的舞。