在军事方面，无论是内阁、议会以及公民大会都没有任何调动亚述军团的权利，行省总督同样如此，不过在各个城镇内都设有城管部负责城市的治安和防卫，分为治安兵和城卫兵。
前者主要是亚述军队当中的退伍老兵组成，无数量上限，后者则是当地的居民组成，所有城市限最多300人。
不过每隔半年左右，退伍老兵们就会组织本城内的青壮年进行一次演练，偶尔会教授他们关于战场上的小知识，至于演练的花费则由国家承担。
退伍老兵们有些还会加入阿萨辛或者圣殿骑士团，以此来监管。
亚述总共有五大军区，东南西北和禁卫军区，隶属于亚述帝国最高指挥府，除了禁卫军区之外，其他军区都设立了军区指挥部、军区屯垦部和军区城管部，只负责和平时期的事务以及被入侵时的防御。
军区指挥部由亚述各军区下辖的军团的军团长、副军团长和祭司组成，平时都驻扎在各自军团的驻扎地，每隔3个月所有军团的军团长必须返回尼尼微汇报军团情况，如果军团长无法前来则由副军团长来汇报。
军区屯垦部负责管理亚述各地的屯垦兵团。
军区城管部这个名字是赛米拉米斯的恶趣味，这个部门是亚述老兵老将们的退休任职的地方，不仅会收养遗弃婴儿，照顾孤寡老人等未来才会有的事情，还是赛米拉米斯在亚述各大城镇的耳目，因此在每个城市都有设立城管部。
在最高指挥府下，还设立装备部、后勤部、情报部、军纪部、参谋部和动员部等几个部门，
装备部负责所有士兵们的武器装备研究、打造和发放。
后勤部负责士兵生活用品、粮食、医疗、煮饭等工作。
情报部其实是阿萨辛明面上的机构，专门负责对内监控，而隐藏在阿萨辛和民间当中的圣殿骑士团则是对外探查，双方共同负责一部分刺杀工作。
军纪部主要是负责士兵的纪律和占领区的战事管理，同时还有军衔和勋章的颁发。
参谋部则是为亚述的将军们出谋划策。
动员部负责全国范围内的士兵动员，也可以简单来说负责暴兵的机构。
亚述各大军团都分别属于各大军区，不过各大军区在战时是不负责指挥的，战争时期所有亚述军团由亚述帝国最高指挥府进行指挥。
最后，作为赛米拉米斯的直属军队的亚述帝国中央禁卫军一共有六支军团，所以也可以称为禁卫六军，虽然赛米拉米斯是从周朝的天子六军这个名字当中得到的灵感，不过此时与亚述同时期的周朝距离实在是太远了，她根本不担心周朝会跑到这里要是什么版权费。
禁卫六军每一支军团的作战方式都各不相同，也因此被赋予了不同的称呼，分别是常胜、铁卫、风暴、天火、玄潮和白穹这六支军团，各军团都是六千人为标准兵力。