各个钞关都派御史及户部主事监督收税。设置钞关则从此时开始，对于这道指令杨峥还是赞同的，这其实就是在征收一些海上的税收，自永乐年后，海禁打开，沿海一带因为大海而繁荣昌盛，不少商家获了不少好处，但大明在这之前，一直没有设置，从而白白丧失了不少银子，可以说是朝廷的一大失误，当然了，说起来这也怪不得朝廷，大明自从朱元璋立国开始，就实行海禁，至于原因，从史书里记载说：方国珍、张士城相继诛服，诸豪亡命，往往纠岛人入寇山东滨海州县，这一说法，《明史纪事本末》也提到：张士城、方国珍余党导倭寇出没海上，焚民居，掠货财，北自辽海、山东，南抵闽、浙、东粤，滨海之区无岁不被其害。
洪武三年，明政府“罢太仓黄渡市舶司”。
洪武七年(，明政府下令撤销自唐朝以来就存在的，负责海外贸易的福建泉州、浙江明州、广东广州三市舶司，中国对外贸易遂告断绝。
到洪武十四年，朱元璋更是“以倭寇仍不稍敛足迹，又下令禁濒海民私通海外诸国”。自此，连与明朝素好的东南亚各国也不能来华进行贸易和文化交流了。
为了不让国人出海，与洪武二十三年，朱元璋再次布“禁外藩交通令”。洪武二十七年(，为彻底取缔海外贸易，又一律禁止民间使用及买卖舶来的番香、番货等。洪武三十年，再次布命令，禁止中国人下海通番。
朱元璋是个做事极为认真的人，做事从来是要么不做，要做就做到极致，在海禁这件事上，他便是如此，为了让防止沿海人民入海通商，他不仅仅是口头上做出了一番说辞，还将此事一律法的形式昭告天下，大明律还规定了严酷的处罚办法：“若奸豪势要及军民人等，擅造三桅以上违式大船，将带违禁货物下海，前往番国买卖，潜通海贼，同谋结聚，及为向导劫掠良民者，正犯比照己行律处斩，仍枭示众，全家边卫充军。其打造前项海船，卖与夷人图利者，比照将应禁军器下海者，因而走泄军情律，为者处斩，为从者边充军。
“这些倒也罢了，毕竟大明国土足够大，江南的江湖也不少，不能出海，那与与沿海周边国家做些贸易也不是不可，但他们似乎小看了朱元璋的决心，除了出海要处罚，便是对参与买卖外国商品的居民也不放过，“敢有私下诸番互市者，必置之重法，凡番香、番货皆不许贩鬻，其现有者限以三月销尽。”
正是在这一错误政策的指引下，大明于洪武十九年(废昌国县，二十年将舟山岛城区和镇外鼓吹两里以外的居民和其他四十六山(岛)的居民徙迁内陆。彻底断绝了大海，没了大海自不用设置关卡，收取船税，整个洪武一朝，根本没这个说法。
但朱元璋寄托希望海禁来巩固大明海关的作用并不显著，反而引起了新的矛盾，由于海禁政策所实施的直接对象是臣民而不是海上反明势力，他不仅不能成为海防的有效手段，甚至在沿海地区激化了一些矛盾。沿海地区人民依海而生，靠海而活，或从事渔业生产，或从事海上贸易。朱元璋“严交通外藩之禁”，堵绝了沿海地区人民的正常谋生之路。如“信国公汤和巡视浙江、福建沿海城池，禁民入海捕鱼”。他们除起来进行斗争之外，已经没有其他选择。诚如明末顾炎武所指出：“海滨民众，生理无路，兼以饥馑荐臻，穷民往往入海从盗，啸集亡命”。“海禁一严，无所得食，则转掠海滨”。