再者，军户地位极端低下，毫无尊严。
按明朝制度，一旦成为军户，就要世世代代在卫所当军户。在卫所里，军官都是世袭的，军户毫无上升空间。而卫所军官的世袭制，又使他们在卫所里成了实际上的“土皇帝”，对军户们可以任意役使，任意支配，不但强迫军户为他们提供各种无偿劳动，还要侵夺国家分配给军户的土地为私产。
这些土地为军官们占有之后，军户除了能留一点糊口的收成外，其余全部归军官所有，甚至一文钱租税也不用向国家交。如此一来，军户实际上成了卫所军官们的农奴，陷入了极其悲惨的境地。因为无法生活，军户们只好全家逃亡他乡，成为流民！
军户地位如此低下，境遇如此悲惨，他们没有大规模造反已经是给足了朱由检面子，还想让他们去上阵杀敌，简直是妄想！
再加上军官世袭制，无能的二世祖越来越多，他们在士绅老财的拉拢腐蚀下，除了上床比人利索，说到上马打仗，简直比登天还难！
朱由检知道，在这样漏洞百出的军制之下，大明后期出了个戚继光、俞大猷，已经算是给太祖老朱给足了面子，可最后的一次次打脸，让大明在军制上走向了募兵的老路。
而戚继光之所以成就了戚家军的威名，还是自己通过招募浙西矿工和农民才完成的。
朱由检深知大明军制的要害，对于方法也十分简单，在原本兵将分离的基础上拔高军户的地位，把无能的世袭军官全部咔嚓！
首先士兵不再种地，就算是没仗打让他们在田间劳作，也是统一管理，以当拉练。对于他们的军饷，让司礼监结合锦衣卫亲自发放，不经过兵部也不经过将领，朱由检要让这些为国家浴血奋战的好男儿知道，他们手里的银子，是大明天子直接给他们的，谁也拿不去！
至于军属，他们在有地种的同时，赋税也比普通农户低许多。不仅如此，每年再给他们额外的军属补助。让大明士兵的老人不至于晚年凄惨，让他们的子女能上的了学，能识得了字！
如此，大明的军队都是朱由检的私军，在没有中间商赚差价！
这个计划要得以实行，最关键的还是钱和粮。
针对这方面，朱由检也不想什么对策了，趁着北方天冷，趁着那些腐臣还没有反应过来，直接抢就行了。
大明天子还没有回京，一道道指令已经散发了出去。
他把自己所能调用的军队人才全部调动起来，在山东、河南、山西、陕西、甘肃、宁夏开始最彻底的大清洗！与此同时，他让方知有和魏驰旭坐镇，在锦衣卫和东厂的辅助下对之前被东林党为首的腐臣驳斥回去的北方寒士进行了面试。
在心性得到肯定的人直接走马上任，取代之前的官位。
在既得利益集团以为小皇帝评定叛军之后会回去好好筹备过年的时候，没想到比之前更冷冽的大屠杀才真正开始！