宋天禧年间诏封为“真武灵应真君”。元朝大德七年加封为“光圣仁威玄天上帝”，一跃而为北方最高神。
明代是真武大帝声势显赫、民间信仰最为普遍的时期。明朝初期，朱元璋的儿子燕王朱棣发动“靖难之变”，夺取了王位。传说在燕王的整个行动中，真武大帝都曾显灵相助，因此朱棣登基后，即下诏特封真武为“北极镇天真武玄天上帝”，并大规模地修建武当山的宫观庙堂，建成九宫八观、三十六庵堂、七十二岩庙、三十九桥、十二亭的庞大道教建筑群，使武当山成为举世闻名的道教圣地；并在天柱峰顶修建“金殿”，奉祀真武大帝神像。因帝王的大力提倡，真武大帝的信仰在明代达到了鼎盛阶段，宫廷内和民间修建了大量的真武庙。
现在道观内供奉真武大帝，一般为披发跣足，端坐于殿堂之上，旁边塑有龟、蛇二将、金童、玉女等从神。真武的诞辰日为农历的三月初三日。
真武大帝相传为北方圣兽玄武的一道化身。
玄武，华夏古代神话中的天之四灵之一，又名龟蛇，源于远古星宿崇拜，是指二十八宿按东南西北分为四象中的北方玄武七宿。
玄武是一种由龟和蛇组合成的一种灵物，四象在华夏传统文化中指青龙、白虎、朱雀、玄武，分别代表东西南北四个方向。北方玄武于八卦为坎，于五行主水，象征四象中的老阴，四季中的冬季，同时也是天之北陆。
玄武的本意就是玄冥，武、冥古音是相通的。玄，是黑的意思；冥，就是阴的意思。
原始社会时期，玄武起源于对古代动物图腾崇拜。无论龟、蛇，抑或神鹿，其原形都是动物。而在所谓动物崇拜说中，仍然认为玄武是龟蛇的合体，有人认为龟、蛇崇拜分别起源于南方和北方地区。
新石器晚期，在黄河下游山东地区开始合流，最后组合为龟蛇合体的玄武形象。或说玄武的来源应从殷墟龟卜的角度去追溯，龟卜的意义是请龟的灵魂到冥间问于先祖，然后把结果带回，以卜兆的形式显示给世人。先祖死后居住于冥，龟的“亚”形腹甲可以代表大地，也可以代表“冥”，神龟因此有了“玄冥”的名称。而“武”、“冥”同音相假，“玄武”即是“玄冥”。
夏朝时期，禹之父母鲧、修己夫妇的象征。孙作云以为玄武源于北方神禺强，其形为龟，后演变为鲧，为鳖氏族酋长，死后化为三足鳖，鳖为其氏族图腾。相传鲧的妻子名“修巳”，在古代“巳”与“蛇”是同字，修巳即“修蛇”。
战国末期，《楚辞·远游》注云：“玄武，北方神名”。
初的玄武指的就是单纯的黑色大龟，并没有涉及蛇。汉代之前，出土的玄武图案都只是神龟的形象。而在汉代以后的壁画、瓦当、砖雕中，玄武的形象发生了变化，在原有的神龟基础上增加了几条蛇，成了龟蛇结合的图案。