开头说了一大堆娓娓动听之语，实际上却没说出心里话。真心话是想说：“减价易地，夺民业生怨。”
徐贞明主张由国家出面开辟水田，水田要力求连成一片，若一片土地属于官吏、勋戚和私人，由政府出面收回，必然损害这些大地主的利益。所谓“夺民业生怨”，实际上不是老百姓“生怨”，而是指这些权贵“生怨”。这才是王之栋上疏的实质所在。
对于徐贞明兴修水利、开发水田的建议，都察院御史左光斗上了《三因十四议》的奏疏，曰：“三因曰：其一因天时，五行之用，水能去水，三江震泽，禹贡所称......过见菖蒲鱼蟹蜃之属，到处有之，风气固然，而谓水偏利在南，偏害在北，火耕水耨，缺五行之二，名曰诬天。其二曰因地利：引漳溉邺，渠郑富秦，龙首渠汉世尤盛，民之歌曰：泾水一石，其泥数斗，且溉且粪，长我禾黍。河源如昨，地脉未改，而谓偏利在古，偏害在今，使匏子之叹长兴，宣房之绩不显，名曰诬地。其三曰因人情：南人惜水如惜血，北人畏水如探汤。习固使然，亦因见其利耳。......近日京东一带，多所开浚，浸浸已见其利所在，州县亦知有水者也。臣私喜之！而谓水不宜北，北不惯水，拂耕凿之情，而失田民之利，名曰诬人。十四议曰：一曰浚川；二曰疏渠；三曰引流；四曰设坝；五曰建闸；六曰设陂；七曰相地；八曰筑塘；九曰招来；十曰力田之科（制定管理法规）；十一曰募富开爵（允许、鼓励大地主兴修水利有功者升官）；十二曰择人；十三曰择将；十四曰兵屯。”
接着，邹元标上了《兴水田植稻十四利疏》。
赵南星上了《京东水田植稻利国利民疏》。
左光斗、邹元标、赵南星的奏观点明确，态度坚决，对徐贞明在京东搞水田给予了满腔热情的支持和鼓励。这下可捅了马蜂窝。那些家在北方的权贵、勋戚们，反对兴修水利、开发水田的奏疏雪片似的飞到万历手中。
面对勋戚、大臣和太监们的激烈反对，万历动摇了。因为，他的皇兄、皇弟和皇室的其他亲属们，都拥有大量土地，且都在京畿周围。稍动一下，就会触动他们的利益。如国家统一征用，对他们的危害将更加直接。他们当中，虽然有人觊觎他的王位，但大多数人还是他的后盾和靠山，至少在表面上还一致拥护他。一旦惹恼了他们，可不是闹着玩的，轻则事事与他作对，重者将颠覆他的皇位。
他不能为一项改革而得罪了他的亲属们。这点，他心中明白。
万历14年3月，皇上下了一道谕旨：“近开水田，人情甚称不便，不宜强行。王之栋既言滹沱河难治，宜且暂停。且南地漫润，北地咸燥，水田如何可作？”
申时行不愧老奸巨猾，随着皇上态度的改变，他轻而易举地放弃了自己的观点。在许多场合，他都改口说：“水田虽好，然南方北方土地究有区别，不可一哄而起，尽开水田。”
在几十年官场生涯中，申时行亲眼目睹了前任首辅张居正的过度自信。此人处理问题偏于果断、刚硬，而不懂迂回和“蕴积”所形成的后果。