然而，为了他们自身的利益，谁也不肯轻易跳出来为海瑞说公道话，只是静观其变。
一些刚进朝廷的青年官员初生牛犊不怕虎，纷纷拍案而起，上本劾奏，揭发、检举房寰的卑鄙肮脏嘴脸，公正评价海瑞的丰功伟绩和高尚情操。
5月中旬，吏部和其他部门的办事进士彭遵古、诸寿贤、顾宪成上疏言事道：“臣等往见南直隶提学御史房寰的疏本，论及右都御史海瑞，讪笑戏骂，无所不至，朝野闻之，无不切齿抱愤！臣等10余岁时，即闻海瑞之名，以当朝伟人，万代瞻仰，至稍知学，得海瑞天下第一事疏，其有功于宗庙社稷事甚大。然以房寰观之，曾有万分之一乎！寰起自寒贱，初尚矫饰，以图荐剡，及稍得志，遂贪污狼籍，私蠹巨万，赀甲乡闾......天下人为寰甚易，为瑞甚难，寰身享贪饕之利，而笑瑞之天迂拙，此臣等之痛心也！且瑞巡抚南畿时......禁绝侵渔，兴水利，议条鞭，一切善政，至今黄童白叟，犹能道之。寰言闾阎骇然，几成大变，何其敢于面欺也！......瑞在先朝，轻一身生死以报国，而臣等辄重区区之进退，不为（海瑞）明之，是无人心者也，故不冒烦琐，冒渎天听。”
那段时间，内阁和万历皇帝被围绕房寰、海瑞二人争辩的奏章搅得焦头烂额。
奏章中，多是为海瑞鸣不平者。房寰显然是势单力薄，失道寡助。万历决定及早平息这场风波。上上之策当然是安慰海瑞，对房寰晓以利害。
万历皇帝责成内阁首辅申时行将南京吏部长官和房寰召来，痛加责备，并给予房寰降两级的处分。
把这一切都做完之后，万历皇帝又传下圣旨曰：“海瑞以直节召用，近因被论力辞，已屡旨挽留，房寰所论不当，已切责，朝廷是非，本自明白，彭遵古等尚未授官，如何便出位言事！本内援引太学生击鼓上书，是何事体？好生轻肆，姑各革去冠带，退回原籍，且令各衙门堂上官约束办事进士，不许妄言渎扰！”
这场正义与邪恶的激烈交锋，以房寰、梅鹍祚的彻底失败而告结束，海瑞以及支持他的力量取得了决定性胜利。
然而，朝廷的屡次安慰和挽留并没有给海瑞带来多少欣喜。一次次的曲折和灾难，给他的心灵上造成了极重的创伤，一个又一个打击使他心力交瘁。
他觉得自己的身体越来越差了。常常感到头晕、乏力，浑身莫名其妙地疼痛。他清醒地意识到，自己留在世上的时间不会太多了。
如果不抓紧时间为百姓多做点事，就来不及了。他要将皇上的挽留和支持锻造成一把尚方宝剑，大刀阔斧地干一场，他不能辜负百姓对他的殷切希望，更不能辜负朝中官吏对他的举荐。是块煤，他要燃尽最后一颗火星；是蜡烛，他要耗尽最后一滴蜡油；是骏马，他要跑完最后一步路程！
海瑞不顾年老体衰，马不停蹄地到几个县私访，了解到实际情况后，制定着力推行“一条鞭法”的方案；将南京城郊两名恶贯满盈的恶霸抓住，严加审讯，上报朝廷后就地正法；对辖区的水利设施进行了重点调查，制定了治理方案......由于连日的奔波劳碌，海瑞病倒了。
连日发高烧，嘴里说着胡话。清醒的时候他感到，这一关恐怕是熬不过去了。此刻，他切切实实地感到了孤独和凄惨。他妻死去多年，无儿无女，亲戚和本家都在老家琼山县，音讯全无。跟前只有一位60多岁的老仆人阿炳。
阿炳看着海瑞浑身发热，高烧得火烫，难受得满床打滚的可怜相，唉声叹气，暗中垂泪。
南直隶的长官和南京道巡抚、巡按虽有人看望过两次，都是例行公事，有人甚至是抱着幸灾乐祸的目的而来。海瑞嫉恶如仇，一些染有劣迹的官员受过海瑞的训斥和惩罚，当地权势和恶霸都受过震慑，他们无不对海瑞恨之入骨，他们恨不得让海瑞快点死去。