南星见陈有年虽说答应为海瑞平反，但态度不甚坚决。如果遇到别的干扰，一旦发生动摇，自己的一切努力就白费了。他想：必须用激将法才能让他坚定信念任用贤能的决心。
于是，南星说：“陈尚书，咱们商议的主意好是好，如果皇上和那些邪派官吏反对，你还敢坚持吗？”
陈有年听了，把脸一沉、脚一跺：“罢罢罢，我豁出去了，舍出命来也要为刚峰先生伸张正义。皇上或是邪派官吏反对，大不了被削籍回乡，有何惧哉！”
赵南星伸出大拇指。但他想起祖父和许多官员因秉公执政却遭遇邪恶势力攻击、陷害，只好被动回乡的经历，觉得不能消极应对、被动挨打。而应该积极采取变通应对之策。正直官员如果不能执政，只能徒怀一腔热血，对江山社稷无补，更不能庇护百姓。
赵南星深思熟虑之后，说了自己刚才的想法。
陈有年高兴地说：“再说说下一步你的具体设想。”
赵南星说：“治疗朝政的痼疾，必须扶正祛邪两个方面着手。一方面，对那些敢斗奸佞、为民谋福的清官，应大胆起用，委以重任，这样才能发挥他们的应有作用。让百姓看到清官终有好下场，官员们也竞相效仿，视为楷模，才能激浊扬清，蔚然成风。另一方面，要严肃法纪，惩治贪官污吏，重整朝纲。只有这样，国家才有振兴的希望。话是这样说，却不知你陈大人有没有这个气魄和胆量？”
陈有年听了，沉吟半晌没有作声。片刻后，他站起来说：“我从做官那天起，就下定决心扶正祛邪，让正直官吏扬眉吐气，大展宏图。只是，担心手下势单力薄，举棋不定。刚才听了你这番话，觉得很有道理，胆气着实壮了不少。既然你拿海瑞和何以尚两位清官将我的军，咱们就从他俩官复原职做起吧。”
南星见陈有年答应为海瑞和何以尚平反，重新起用二人，心中非常高兴。唉，在官场，遇上这样的顶头上司着实不易。他决心配合尚书大人，想方设法把扶植正直官吏、打击贪官污吏这件事做好。
于是，二人当场草拟了奏疏，将海瑞及同海瑞情况相似的何以尚上报内阁，要求为他们平反昭雪，重新起用。
又调出海瑞的档案材料及广东巡抚邓纯吾等人举荐海瑞的奏疏附上。二人经过商议，请求朝廷委任海瑞为南京道布政司右道政（正四品），同时报上了何以尚的拟任官职。时隔不久，万历皇帝降下旨意，恩准起用海瑞、何以尚。任命海瑞为南京道布政司右道政（正四品），也任命了何以尚相应官职。
海瑞——这位铁面无私的大清官在古稀之年重新出山，京城内外的百姓欢欣鼓舞，朝廷内外的文武官员十分敬仰。
赵南星和陈有年对这件事都很高兴。这是南星进京为官以来办成的第一件得意之事。